Ayakta su içmenin zararları genellikle sıvı dengesi ile doğrudan bağlantılıdır. Bunun haricinde ise suyu ayakta içmenin zararları arasında; tüketilen sıvının direkt olarak midenin alt kısmına inmesi yer alır.
Kişilerin ayakta sıvı tüketiminde bulunduğu zaman içilen sıvının doğrudan on iki parmak bağırsağına gittiği bilinir. Ayakta su içmenin zararlarına bağlı olarak kişilerde bazı sağlık sorunları ortaya çıkacaktir.
Ayakta su içmenin zararlarından birisi de ayakta içilen suyun mide içerisindeki asitlerle karışmamasıdır.
Suyun mide içerisinde yer alan asitler ile karışmaması halinde de vücutta bulunan zararlı bakteriler ölmez.

Ayakta Su İçmeyi Bırakmanın Sağlık Açısından Faydaları Nelerdir?
Ayakta su içmeyi bıraktığınız zaman ülser gibi mide rahatsızlıklarına yakalanma riski azalır.
Oturarak su içildiği zaman su, midede birikir. Mide içerisinde biriken su midedeki asitler ile birbirine karışır.
Su ile mide asidinin birbirine karışması soncunda ise vücutta yer alan mikroplar ölür. Bu mikropların ölmesine bağlı olarak da kişiler birçok hastalıktan korunmuş olur.
Bazı bilgiler doğrultusunda, oturarak su içmenin kolera hastalığından dahi koruma sağlayacağı söylenir.
Ayakta su içmenin zararlarına bağlı olarak en çok midenin bu konuda zorlanacağı bilinir.Mide haricinde ise bağırsakların zarar görebilme ihtimali bulunur.  Suyun mideye hızlı girmesi halinde ise bu durum mukozaya zarar verir.
Mukozaya zarar gelmesine bağlı olarak midenin iç dokusu da zarar görmeye başlar. Bu durumda, neden ayakta su içilmez sorusuna; midenin zarar görmemesi için ayakta su içilmemesi gerekir yanıtını vermek doğru olabilir.
Midenin iç dokusunun zarar görmesi halinde reflü, ülser, gastrit ve diğer mide problemlerinin ortaya çıkma riski bulunur. 
Aynı zamanda ayakta su içmenin böbreklere ve idrar yoluna da zarar verdiği düşünülür.

Ayakta su içmenin sünnete yeri nedir?

Bir hadisde ayakta su içmenin zararına şu şekilde işaret etmiştir: …“Eğer ayakta su içen kimse midesine verdiği zararı bilseydi içtiği suyu şüphesiz ki geri kusardı” (Abdürrezzak 10/427 hadis 19588).
Yine aynı konu ile alakalı olarak; “Sizden biriniz ayakta su içmesin. Her kim unuturda içerse kusmaya çalışsın” buyurmuştur (Müslim eşribe Hadis 116)